Alla organismer lämnar spår av DNA i den miljö de lever i, inklusive de som lever i havet. Vi kallar den typ av DNA, miljö-DNA (eDNA). Exempel på källor för eDNA är avföring, slem, gameter, hudavlagring och döda celler. Vi kan provta detta DNA och sedan analysera proverna för att se vilka organismer som har befunnit sig på platsen! Inom projekt VEKTOR kommer vi använda oss av eDNA för att leta efter invasiva arter. För provtagning samlas vattetenprover in från området vi vill studera, som sedan pumpas genom ett filter. Filtret har ett tillräckligt litet nät, så att DNA:t fångas upp när vattnet passerar igenom. På bilden nedan kan du se student Lydia Rysavy samla in prover i fält genom att pumpa vatten genom ett filter. Vi använder vatten på flaska som ”blanka” prover för att säkerställa att inget DNA från luften eller från vår utrustning kontaminerar filtren.
Tillbaka i labbet hämtar Lydia DNA från filtret i en process som kallas ”extraktion”. Hon är väldigt noga med att inte utsätta filtret för DNA från labbet. Efter denna process är proverna redo att sekvenseras och analyseras vidare.
Lydia Rysavy arbetar med vårt bärbara laboratorium ute i fält och pumpar vatten genom ett filter med en batteridriven pump.